Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYO6Q9UM54 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO6Q9UM54 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms