Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms