Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms