Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms