Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms