Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms