Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms