Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA1Q9UIW2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms