Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms