Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms