Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms