Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPC1L1Q9UHC9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NPC1L1Q9UHC9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms