Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms