Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms