Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms