Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRPC4Q9UBN4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1243 ms