Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms