Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms