Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms