Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms