Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL20A1Q9P218 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL20A1Q9P218 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms