Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRACLQ9P1F3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRACLQ9P1F3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms