Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms