Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms