Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DLL3Q9NYJ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms