Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms