Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms