Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms