Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF38Q9NXL2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms