Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms