Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms