Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms