Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMRT3Q9NQL9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMRT3Q9NQL9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms