Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms