Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms