Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIAA1549Q9HCM3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms