Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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