Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD3Q9H7E2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms