Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms