Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNMDQ9H2S6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNMDQ9H2S6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNMDQ9H2S6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNMDQ9H2S6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNMDQ9H2S6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNMDQ9H2S6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNMDQ9H2S6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNMDQ9H2S6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNMDQ9H2S6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNMDQ9H2S6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms