Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDT1Q9H211 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDT1Q9H211 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDT1Q9H211 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDT1Q9H211 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDT1Q9H211 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDT1Q9H211 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDT1Q9H211 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDT1Q9H211 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDT1Q9H211 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDT1Q9H211 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDT1Q9H211 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms