Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC8Q9H0W5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms