Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF3Q9H094 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms