Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LSG1Q9H089 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms