Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms