Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCOLN1Q9GZU1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms