Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms