Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms