Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPEF2Q9C093 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPEF2Q9C093 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms