Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXP3Q9BZS1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXP3Q9BZS1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXP3Q9BZS1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXP3Q9BZS1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXP3Q9BZS1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXP3Q9BZS1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXP3Q9BZS1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXP3Q9BZS1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXP3Q9BZS1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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