Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms